Blue e Blaine chegam à Ilha Cerise, o quartel-general da Elite dos Quatro! Mas inimigos de longa data já os aguardavam por lá, os três comandantes da Equipe Rocket!! Quando Yellow, Green e Bill também os encontram no local, esses oito treinadores Pokémon formam uma aliança inusitada e partem para a batalha final contra os membros da poderosa Elite dos Quatro!