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Depois da aula, Yugi e seus amigos se dirigem ao museu Domino, onde está uma tábua de pedra, em busca das memórias perdidas do Faraó. E, no momento em que os cards Deuses se unem à tábua,Yugi parte com uma luz intensa para o mundo de suas memórias! O cenário é o Egito de três mil anos atrás, onde ele era o próprio Faraó. A sua volta, há personagens muito parecidos com as pessoas que conheceu no mundo atual, além de sacerdotes escolhidos pelas relíquias do Milênio. Então, um ladrão que se apresentou como Bakura ataca o palácio exigindo as relíquias.
