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A dupla Togusa e Tsunagi é enviada para uma nova missão no oásis do Saara. A única pista que eles carregam é uma lembrança gravada na memória de uma vítima. O capítulo 28 de The Ghost in The Shell – The Human Algorithm faz parte da continuação direta da história de The Ghost in the Shell 1.5, do original de Shirow Masamune.
